人體本身就是一個非常複雜的微生物生態系統。自出生那一刻起，我們開始經由食物、水、空氣及皮膚的接觸，與環境中各種微生物產生密切的關係。隨著年齡增長，人體活動越多，接觸到的微生物數量也逐漸增加。科學家發現，存在人體皮膚、黏膜、消化道、生殖泌尿道等等部位的微生物種類超過千種，數量超過百兆，幾乎是人體細胞十倍以上。而其中99%以上的菌都存在我們的腸道裡。腸道菌對人體來說，不只是寄生的細菌而已，可以說是與我們共度一生的「必要器官」，腸道菌和人類一起走過千萬年演化的歷史，是人類不折不扣的生命共同體。在2010年，由美國德州科技大學的萊特（Mark Lyte）發表一篇論文〈我們腸道裡的微生物器官，是我們身體恆定與疾病的驅動者〉。萊特形容人體與腸道裡的微生物間的關係：如果我們的身體是一輛豪華轎車，腸道菌就是負責開車的司機。腸道菌是我們身心健康的決定者、推動者。因此，腸道裡菌相的平衡就決定了人體身心整體的健康。沒有腸道菌，我們生命就會停止。腸道菌失衡，我們就不健康，產生各種疾病。
