雖然日本動畫中兄妹題材到底是從何時開始流行起來的很難說清，不過《妹妹公主》這部作品是很多妹控阿宅的覺醒之作，動畫中的各位妹妹對於男主角「哥哥」的稱呼都不同，而在今天開播的兄妹題材動畫《我喜歡的是妹妹但不是妹妹》中，開場就是《妹妹公主》動畫中的角色集體登場，而且13 位妹妹角色的聲音都是當年的聲優全新錄製的，這部動畫第一話的預算大概是砸在這聯動上了。
《我喜歡的是妹妹但不是妹妹》開場會讓人覺得看錯了動畫，因為上來就是《妹妹公主》的13 個妹妹角色依次出現在男主角的夢中，以她們各自特有的稱呼喊男主角「哥哥」，讓人一度有種「今夕何年」的感覺，而且這些聲音都是當年的聲優全新錄製的，這些聲優包括桑谷夏子、望月久代、小林由美子、堀江由衣、千葉千惠巳、柚木涼香、冰青、神崎千路、川澄綾子、嘉數由美、半場友惠、水樹奈奈、冰上恭子（第一季動畫的原創角色山神真深美的聲優），在13 位聲優的配音感言中提到最多的就是這次聯動給了大家一種開同學會的感覺，當年一起配《妹妹公主》動畫的同伴再次相聚。
根據《我喜歡的是妹妹但不是妹妹》動畫監督古川博之的說法，在與系列構成百瀨祐一郎開會的時候，就想，如果這部動畫能和《妹妹公主》這部經典妹系動畫聯動的話就最好了，因為監督和系列構成提到妹妹這類角色大腦裡最先浮現的就是《妹妹公主》這部作品，而且監督古川博之第一次擔任動畫原畫就是在《妹妹公主》第一季動畫製作中，所以就提出了這個聯動的計劃，在聯動確定後監督非常高興，覺得是實現了自己的一個夢想。至於開場《妹妹公主》角色登場的分鏡也是出自監督之手，而動畫正片的分鏡是出自副監督，唯有《妹妹公主》角色的分鏡監督絕對不能讓給別人做。這次的聯動配音也非常順利，當年為《妹妹公主》配音的聲優們，雖然時隔多年再次為角色配音但卻非常順利，感覺用了不到十分鐘就完成了配音。
